Phòng thí nghiệm (PTN) Quan trắc Môi trường và Khí hậu được thành lập năm 2022.  Đây là phòng thí nghiệm chuyên ngành phục vụ cho công tác giảng dạy, nghiên cứu. Phòng thí nghiệm hoạt động thường xuyên tạo điều kiện cho học viên, sinh viên thực hành, thí nghiệm để củng cố lý thuyết, hỗ trợ các học phần chuyên ngành và phục vụ cho công tác nghiên cứu khoa học ở cán bộ, sinh viên.

Từ năm 2008 Khoa Môi Trường & Tài nguyên Thiên nhiên được Trường Đại Học Cần Thơ phân giao sử dụng một tòa nhà chính với tổng diện tích sàn là 5.027.00 m2 sử dụng cho phòng học, văn phòng các bộ môn, phòng thí nghiệm; và một diện tích đất là 19.238.00 m2 cho các hoạt động đào tạo, nghiên cứu khoa học, ngoài ra còn có phòng học, weblab nhà lưới,, khu tự học và dịch vụ hỗ trợ sinh viên (nhà xe, canteen).

Đến tháng 12/2022 các phòng thí nghiệm cũ được nâng cấp về trang thiết bị, diện tích sử dụng và được bố trí ở 02 tòa nhà ATL và RLC theo Quyết định số 6404 ngày 29/12/22 , Theo quyết định này Khoa sẽ có 14 phòng thí nghiệm